АТОНИ́Я, -и, ж. Мед. Ослабление напряжения, возбудимости тканей и органов, вялость тканей и мускулов.
Все значения слова «атония»КИШЕ́ЧНИК, -а, м. Совокупность кишок — часть пищеварительного тракта человека или животного, начинающаяся за желудком и заканчивающаяся прямой кишкой.
Все значения слова «кишечник»Душицу используют для лечения атонии кишечника, диспепсии, плохого аппетита и пищеварения, спазм в желудке и кишечнике, воспалительных заболеваний печени, почек и мочевого пузыря, отёков, нервных расстройств, бессонницы, кашля, удушья, ангины, туберкулёза лёгких, ревматизма, невралгий, параличей, инсультов и эпилепсии.
Возможно, что так называемая атония кишечника, ослабление его движений в связи с атрофичностью мышц, ведёт к развитию неблагоприятной и неестественной микробной флоры, способной отравлять организм токсинами.
Причина непонятна, но если учесть, что у девочки ярко развитая атония кишечника, я бы предположил, что она просто съела много грубой твёрдой пищи, которая и вызвала раздражение слизистой.